Expression des histones déméthylases dans les cellules hématopoïétiques humaines et les leucémies aiguës
Thèse ou mémoire / Thesis or Dissertation
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Maîtrise / Master's
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Mots-clés
- Épigénétique
- Histones déméthylases
- Hematopoietic stem cells
- Self-renewal
- Cord blood
- Myeloid leukemia
- MonoMAC syndrome
- Cellules souches hématopoïétiques
- Autorenouvellement
- Sang de cordon
- Leucémie myéloïde
- GATA2
- Syndrome de MonoMAC
- Epigenetic
- Histone demethylases
Organisme subventionnaire
Résumé
Résumé
L’importance des modificateurs de la chromatine dans la régulation de l’hématopoïèse et des hémopathies malignes est illustrée par l’histone méthyltransférase Mixed-Lineage Leukemia (MLL) qui est essentielle au maintien des cellules souches hématopoïétiques (CSH) et dont le gène correspondant, MLL, est réarrangé dans plus de 70% des leucémies du nourrisson. Les histones déméthylases (HDM), récemment découvertes, sont aussi impliquées dans le destin des CSH et des hémopathies malignes. Le but de ce projet est d’étudier l’expression des HDM dans les cellules
hématopoïétiques normales et leucémiques afin d’identifier de potentiels régulateurs de leur destin.
Nous avons réalisé un profil d'expression génique des HDM par qRT-PCR et par séquençage du
transcriptome (RNA-seq) dans des cellules de sang de cordon (cellules CD34+ enrichies en CSH et
cellules différenciées) et des cellules de leucémie aiguë myéloïde (LAM) avec réarrangement
MLL. Les deux techniques montrent une expression différentielle des HDM entre les populations
cellulaires. KDM5B et KDM1A sont surexprimés dans les cellules CD34+ par rapport aux cellules
différenciées. De plus, KDM4A et PADI2 sont surexprimés dans les cellules leucémiques par
rapport aux cellules normales. Des études fonctionnelles permettront de déterminer si la
modulation de ces candidats peut être utilisée dans des stratégies d’expansion des CSH, ou comme
cible thérapeutique anti-leucémique. Nous avons aussi développé et validé un nouveau test
diagnostique pour détecter les mutations de GATA2 qui code pour un facteur de transcription clé de
l’hématopoïèse impliqué dans les LAM. Ces travaux soulignent l’importance des facteurs
nucléaires dans la régulation de l’hématopoïèse normale et leucémique.
The importance of chromatin modifiers in regulation of hematopoiesis and hematologic malignancies is illustrated by the Mixed-Lineage Leukemia (MLL) histone methyltransferase, which is essential to maintain hematopoietic stem cells (HSC) and whose corresponding gene, MLL, is rearranged in over 70% of infant leukemia. The recently discovered histone demethylases (HDM) are also involved in HSC fate and in hematologic malignancies. The purpose of this project is to study the expression of HDM in normal and leukemic hematopoietic cells to identify potential regulators of their fate. We performed a comprehensive gene expression profile of HDM by qRTPCR and transcriptome sequencing (RNA-seq) in cord blood cells (CD34+ cells enriched in HSC and differentiated cells) and in acute myeloid leukemia (AML) cells with MLL rearrangement. Both techniques revealed differential expression of HDM between these cell populations. KDM5B and KDM1A are overexpressed in CD34+ cells compared to differentiated cells. Moreover, KDM4A and PADI2 are overexpressed in leukemic cells compared to normal cells. Functional studies will determine whether modulation of these candidates can be used in HSC expansion strategies or as anti-leukemic drug target. We have also developed and validated a new diagnostic test to detect mutations of GATA2, a gene encoding a key transcription factor involved in hematopoiesis and in AML. This work highlights the importance of nuclear factors in the regulation of normal and leukemic hematopoiesis.
The importance of chromatin modifiers in regulation of hematopoiesis and hematologic malignancies is illustrated by the Mixed-Lineage Leukemia (MLL) histone methyltransferase, which is essential to maintain hematopoietic stem cells (HSC) and whose corresponding gene, MLL, is rearranged in over 70% of infant leukemia. The recently discovered histone demethylases (HDM) are also involved in HSC fate and in hematologic malignancies. The purpose of this project is to study the expression of HDM in normal and leukemic hematopoietic cells to identify potential regulators of their fate. We performed a comprehensive gene expression profile of HDM by qRTPCR and transcriptome sequencing (RNA-seq) in cord blood cells (CD34+ cells enriched in HSC and differentiated cells) and in acute myeloid leukemia (AML) cells with MLL rearrangement. Both techniques revealed differential expression of HDM between these cell populations. KDM5B and KDM1A are overexpressed in CD34+ cells compared to differentiated cells. Moreover, KDM4A and PADI2 are overexpressed in leukemic cells compared to normal cells. Functional studies will determine whether modulation of these candidates can be used in HSC expansion strategies or as anti-leukemic drug target. We have also developed and validated a new diagnostic test to detect mutations of GATA2, a gene encoding a key transcription factor involved in hematopoiesis and in AML. This work highlights the importance of nuclear factors in the regulation of normal and leukemic hematopoiesis.
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