Faculté de médecine vétérinaire – Thèses et mémoires

URI permanent de cette collectionhttps://hdl.handle.net/1866/2966

Cette collection présente les thèses et mémoires des étudiant.e.s la Faculté de médecine vétérinaire de l'Université de Montréal.

1990 - : Couverture exhaustive (quelques titres manquants)
avant 1990 : Période non couverte ou couverture partielle

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La sécurité et l’efficacité du bloc du plan abdominal transverse (TAP bloc) chez le chat
Garbin, Marta; Steagall, Paulo (2025-05)
L'anesthésie locorégionale (ALR) joue un rôle fondamental dans la gestion de la douleur périopératoire. Le bloc du plan transverse de l'abdomen (TAP) échoguidé est une technique d'ALR développée en médecine humaine pour fournir une analgésie pour la chirurgie abdominale et réduire la consommation d'opioïdes et les effets secondaires. Il consiste à injecter un anesthésique local dans le plan fascial superficiel par rapport au muscle transverse de l'abdomen (le muscle le plus interne de la paroi abdominale) pour désensibiliser les nerfs responsables de l'innervation somatique de l'abdomen. Récemment, le bloc TAP échoguidé a été introduit dans l'anesthésie vétérinaire. Le présent programme de doctorat visait à développer une technique de bloc TAP chez les chats domestiques et à garantir l'efficacité et la sécurité du bloc TAP avec la bupivacaïne chez cette espèce. Nos principaux objectifs étaient : d'évaluer 1) la faisabilité du bloc TAP chez le chat par une étude anatomique et d'imagerie de la distribution de l'anesthésique injecté sur des cadavres ; 2) la sécurité de la bupivacaïne administrée avec le bloc TAP par les concentrations plasmatiques et découlant d'une pharmacocinétique variable ainsi que des effets cardiotoxiques potentiels chez les chattes ; 3) l'efficacité analgésique du bloc TAP échoguidé avec de la bupivacaïne chez les chattes subissant une ovariohystérectomie (OVH) par l’évaluation de la douleur périopératoire. Nos hypothèses étaient les suivantes 1) une nouvelle approche du bloc TAP échoguidé (deux sites d'injection au lieu d'un) entraîne une distribution plus large de l'injectât et une plus grande implication des nerfs dans le TAP ; 2) une dose de 2 ou 2,5 mg/kg de bupivacaïne injectée dans le TAP ne provoque aucun signe de toxicité et produit des concentrations plasmatiques inférieures aux concentrations toxiques de bupivacaïne chez les chats ; 3) le bloc du TAP avec la bupivacaïne fournit une meilleure analgésie postopératoire (scores de douleur inférieurs dans le groupe bupivacaïne) et réduit la prévalence de l'analgésie de secours par rapport au traitement placebo. Le projet a été divisé en quatre études : trois études prospectives, randomisées, en aveugle et une étude pilote. 1) Étude anatomique : deux approches du bloc TAP échoguidé ont été réalisées sur huit cadavres de chats adultes dans le but de définir la meilleure technique. La diffusion d'une solution injectée de 1 mL/kg et l'implication des nerfs thoraco-lombaires ont été évaluées par tomodensitométrie et dissection. 2) Étude de sécurité (pharmacocinétique) : 12 chats femelles anesthésiés (n = 6/groupe) ont reçu un bloc TAP (technique développée dans l'étude 1) avec 2 ou 2,5 mg/kg de bupivacaïne avant l'OVH. Des échantillons de sang en série ont été prélevés avant et jusqu'à 8 heures après le bloc TAP. Les analyses plasmatiques de la bupivacaïne ont été réalisées par chromatographie liquide-spectrométrie de masse, modèle à un compartiment et analyse non compartimentale. 3) Étude d'efficacité : 32 chats femelles (n = 16/groupe) ont reçu une solution saline à 0,9 % (placebo ; groupe témoin) ou de la bupivacaïne (2,5 mg/kg d'après les résultats de l'étude 2 ; groupe bupivacaïne) via un bloc TAP échoguidé avant l'OVH. La douleur postopératoire et la prévalence de l'analgésie de secours pour chaque traitement ont été comparées. 4) Étude pilote : la faisabilité de cette technique de bloc TAP a été étudiée sur trois cadavres de chats obèses. La distribution et la coloration des nerfs de deux volumes d'injectât basés sur le poids maigre et le poids réel du corps ont été évaluées par dissection. Nous avons démontré que 1) le bloc TAP échoguidé est faisable chez les chats ; cependant, l'injection intrapéritonéale est un risque possible. Une technique d'injection à deux points a permis d'impliquer les branches nerveuses à l'intérieur du TAP de manière plus large et cohérente qu'un seul point d'injection. 2) Les deux doses de bupivacaïne administrées par injection TAP ont produit des concentrations inférieures aux niveaux toxiques chez les chats, et aucun événement cardiovasculaire indésirable n'a été observé. 3) Le bloc TAP bilatéral à deux points d'injection avec une dose de 2,5 mg/kg de bupivacaïne a fourni une analgésie postopératoire efficace chez la plupart des chats subissant une OVH. Chez les chats de petite taille, l'échec du bloc est un risque possible. 4) Chez les chats obèses, le volume d'injections basé sur le poids corporel réel a coloré plus de branches nerveuses dans le TAP que le volume basé sur le poids corporel maigre. Ce projet de doctorat a fourni des preuves de l'efficacité et de la sécurité d'une technique de bloc TAP en deux points (sous-costal et latéral) échoguidée chez des chats sains de poids normal subissant une OVH. Il a prouvé qu'une dose allant jusqu'à 2,5 mg/kg de bupivacaïne peut être administrée en toute sécurité via le bloc TAP chez des chats en bonne santé, fournissant une analgésie abdominale après une OVH. En plus de ces informations sur le bloc TAP chez les chats de poids normal, le projet suggère qu'un volume d'anesthésique local basé sur le poids corporel réel devrait être utilisé lors de l'application de la technique chez les chats obèses.
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Production d’anticorps contre les antigènes érythrocytaires félins non-AB (FEA) : documenter leur immunogénicité et assurer la pérennité du typage sanguin
Bangash, Mohammad Yasan; Blais, Marie-Claude (2025-05)
L'identification des antigènes érythrocytaires félins (Feline Erythrocyte Antigen; FEA) 1-5, au-delà du système de groupe sanguin AB, par le biais d'alloanticorps naturels (AcN), et la découverte ultérieure du FEA 6 par la production d'anticorps post-sensibilisation, ont fait progresser de manière significative la médecine transfusionnelle féline. Ces découvertes ont motivé des recherches sur l'immunogénicité de ces antigènes et des efforts pour préserver les capacités de typage des FEA par la mise en banque d'anticorps. Notre travail s'est concentré sur l'étude de l'immunogénicité des antigènes félins et sur la production d'anticorps pour permettre un typage précis. Dans un premier temps, nous avons évalué l'immunogénicité du FEA 6 et produit des anticorps polyclonaux anti-FEA 6. Deux chats de type A négatifs pour FEA 6 et n'ayant jamais reçu de transfusion ont reçu du sang positif pour FEA 6, apparié pour d'autres FEA, ce qui a entraîné la production d'anticorps anti-FEA 6. Ces anticorps ont montré une concordance presque parfaite (kappa = 0,87) avec les anticorps anti-FEA 6 de référence, et une banque de sérum a été créée pour la recherche et l'utilisation clinique. Dans un effort séparé, nous avons cherché à produire des anticorps monoclonaux murins contre les FEAs, en se concentrant sur FEA 1, reconnaissant leur potentiel pour une plus grande stabilité et durabilité. En utilisant une technique conventionnelle d'hybridomes, cinq souris (3 A/J et 2 SLJ) ont été immunisées avec des globules rouges (GR) félins de type A FEA 1-positifs. Parmi les 2 297 hybridomes sélectionnés, 60 clones ont agglutiné les globules rouges félins, mais aucun n'était spécifique à FEA 1. Tous les clones réactifs ont agglutiné différents types de globules rouges félins, y compris des globules rouges FEA 1 positifs, FEA 1 négatifs et des globules rouges de type B. Cet effort n'a pas permis de produire des anticorps anti-FEA 1 ou tout autre anticorps ayant une pertinence potentielle en médecine transfusionnelle féline. Notre étude met en évidence les difficultés liées à la production d'anticorps spécifiques contre les FEA. Bien que nous ayons validé avec succès l'immunogénicité de FEA 6 et établi une banque d'anticorps polyclonaux anti-FEA 6, des obstacles importants subsistent dans le développement d'anticorps monoclonaux stables et spécifiques. Les recherches futures pourraient se concentrer sur l'identification des caractéristiques moléculaires et de la base génétique des FEA, car ces connaissances fondamentales pourraient guider les efforts visant à affiner les protocoles d'immunisation et à explorer d'autres techniques de préparation d'antigènes, facilitant finalement la production d'anticorps monoclonaux.
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Advancing mosquito surveillance in the Arctic for population monitoring and virus detection
Villeneuve, Carol-Anne; Leighton, Patrick; Lecomte, Nicolas; Dusfour, Isabelle (2025-04)
Le réchauffement planétaire qui impacte l'Arctique affaiblit la barrière climatique et favorise la propagation de virus transmis par les moustiques, constituant une menace pour la santé humaine. Dans ces régions nordiques, les virus les plus susceptibles d'émerger ou de réapparaître sont ceux du sérogroupe californien (CSGV), en particulier le virus Jamestown Canyon (JCV) et le virus Snowshoe Hare (SSHV). Ces virus sont transmis à l'homme par des moustiques infectés du genre Aedes Meigen, 1818 dits « à pattes noires », difficiles à différencier en raison de leur morphologie similaire. En raison de l'absence de travaux récents sur les moustiques dans l'Arctique de l’Amérique du Nord au cours des quarante dernières années, la distribution et le rôle de vecteur des moustiques restent mal connus, ainsi que la gamme de virus qu'ils peuvent potentiellement transmettre. Cette thèse vise à répondre à la question de recherche suivante : Quelles approches permettent d’améliorer les connaissances sur les populations de moustiques et la circulation des virus du sérogroupe californien dans l’Arctique de l’Amérique du Nord, afin de mieux comprendre la dynamique des arbovirus émergents dans cette région ? Dans un contexte de surveillance des moustiques dans l'Arctique de l’Amérique du Nord, trois objectifs clés se dégagent : 1) Développer un protocole d'échantillonnage efficace et adapté aux régions arctiques isolées; 2) Évaluer la performance du codage à barres ADN, plus précisément le Cytochrome C Oxidase Subunit I (COI) et l’Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2), pour identifier les espèces de moustiques les plus fréquentes et morphologiquement similaires; 3) Mettre en place un programme de surveillance des moustiques axé sur les CSGV à l'échelle de l'Arctique. Pour le premier objectif, nous avons collecté des moustiques dans sept régions nordiques à l’aide d’un filet à papillon. Cette méthode d'échantillonnage s’avère être efficace pour la capture de moustique dans les communautés inuites et les stations de recherche en milieu éloigné. Pour le deuxième objectif, nous avons d'abord analysé morphologiquement quatre espèces de moustiques arctiques étroitement apparentées à l'aide de clés dichotomiques : Aedes punctor (Kirby, 1837) et Aedes hexodontus Dyar, 1916, Aedes impiger (Walker, 1848) et Aedes nigripes (Zetterstedt, 1838). Par la suite, nous avons exploré la performance de l'utilisation du codage à barres de l'ADN (COI et ITS2) pour identifier ces espèces. Nos résultats démontrent qu'il est pratiquement impossible de différencier morphologiquement Ae. punctor et Ae. hexodontus dans leur distribution nordique de la forêt boréale (i.e., taïga). De plus, certains spécimens collectés à Kuujjuaq, dans le nord du Québec, présentent un mélange des traits morphologiques associés à ces deux espèces. Pour ce qui est de la performance des codes-barres d’ADN, le COI et l’ITS2 ne peuvent pas différencier Ae. punctor et Ae. hexodontus, alors que seul le code-barres COI permet de différencier Ae. impiger et Ae. nigripes. Pour le troisième objectif, nous avons mis en œuvre un programme de surveillance des moustiques sur trois ans, couvrant neuf régions différentes de l'Arctique de l’Amérique du Nord afin de détecter les CSGV. En tout, nous avons capturé 4084 moustiques et identifié 19 espèces distinctes. Nos résultats démontrent la présence du JCV dans dix espèces de moustiques sur sept sites distincts, tandis que le SSHV n'a été trouvé que dans une seule espèce sur un seul site. En outre, nos résultats incluent la toute première détection du JCV en Amérique du Nord chez Ae. impiger, Aedes pionips Dyar, 1919 et Aedes euedes Howard, Dyar, & Knab, 1913, ainsi que la première mention du JCV au Groenland. Cette thèse apporte une contribution significative en fournissant de nouvelles informations sur les populations de moustiques de l'Arctique de l’Amérique du Nord et sur la présence du JCV et du SSHV dans cette région. Nos résultats fournissent des données actualisées sur la liste de présence de plusieurs espèces de moustiques arctiques. De plus, nous avons contribué au débat en cours sur le statut taxonomique d'Ae. punctor et d'Ae. hexodontus dans la partie septentrionale de leur aire de répartition tout en reconnaissant la nécessité de poursuivre les recherches sur leur rôle de vecteur et sur leur cycle de développement de ces deux espèces, nous proposons de les regrouper sous le nom d'Aedes punctor-hexodontus. Nos résultats sur la distribution des moustiques serviront de point de référence important pour surveiller les changements de population de moustiques arctiques à l'avenir. Dans l'ensemble, cette thèse a permis de mettre à jour nos connaissances sur la distribution des espèces de moustiques et la présence du CSGV dans l'Arctique de l’Amérique du Nord, tout en formulant des recommandations pour les futurs programmes de surveillance.
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Rôle d’Ankyrin-repeat and SOCS-Box protein 9 (ASB9) dans l'inhibition de PAR1 et la voie de signalisation MAPK dans l'ovaire bovin
Naranjo Gonzalez, Daniela Carolina; Ndiaye, Kalidou (2024-04)
Les protéines Ankyrin-repeat and SOCS-box (ASB), incluant ASB9, sont membres des ubiquitine ligases E3 et régulent la prolifération cellulaire, la différenciation, la carcinogenèse et le cycle cellulaire dans divers types de cellules, y compris les cellules de granulosa (GC). Nous avons précédemment identifié ASB9 comme un gène induit par l’ hormone lutéinisante et la gonadotrophine chorionique humaine (LH/hCG) dans les GC des follicules ovulatoires bovins. Nos résultats antérieurs ont également permis d’identifier des protéines partenaires cibles d’ASB9 dans les GC dont protease-activated receptor 1 (PAR1). Cependant, les rôles exacts d'ASB9 dans l'activité des GC et son impact sur diverses voies de signalisation doivent être pleinement étudiés. Dans ce projet, nous avions pour objectif d'étudier les mécanismes d'action d'ASB9 dans les GC et de déterminer si l'induction d'ASB9 par la LH/hCG est nécessaire pour la régulation de gènes cibles tels que PAR1 et des voies de signalisation impliquées dans la fonction et l'activité des GC. Des GC en culture ont été traitées avec différentes doses de FSH, LH et thrombine. Les analyses RT- qPCR ont montré que la thrombine augmentait l'expression de PAR1 dans les GC (P<0.05) alors que la FSH n'avait aucun effet sur PAR1. Le traitement avec la LH a réduit de manière significative PAR1 (P<0.05), même en présence de thrombine, démontrant une régulation négative de PAR1 par la LH, possiblement via une induction concomitante d'ASB9 par la LH. Les résultats de Western blot montrent que l'expression d'ASB9 dans les GC in vitro est augmentée 12 heures après le traitement avec LH (P<0.05). De plus, le profil de phosphorylation de MAPK3/1 (ERK1/2) dans les GC traitées avec la thrombine suggère un contrôle médié par PAR1, tandis que la présence d'ASB9 dans les GC semble avoir un effet négatif sur la voie MAPK. Enfin, la thrombine pourrait bloquer très tôt (dans 1 heure de traitement) l'effet négatif d'ASB9 sur PAR1 alors que cette protéase ne semble pas affecter l'effet d’ASB9 à 6 et 12 heures de traitement. Les tests de prolifération ont montré qu'ASB9 régulait négativement le nombre des GC ainsi que le marqueur de prolifération CCND2, tandis que le marqueur d'apoptose BAX2 était augmenté avec le traitement avec la LH. Ensemble, ces données démontrent le mode d'action et les effets fonctionnels d'ASB9 sur la régulation de PAR1 avec des conséquences sur la prolifération, la différenciation et l'activité stéroïdogène des GC, suggérant un rôle crucial d’ASB9 dans le processus ovulatoire chez l'espèce bovine.
Embargo
Vésicules extracellulaires chez Clostridium perfringens comme stratégie vaccinale pour la protection des poulets de chair contre l’entérite nécrotique
Guerrero Tinjaca, Laura Alejandra; Boulianne, Martine (2024-04)
L'entérite nécrotique chez les poulets de chair, causée par la bactérie Clostridium perfringens, se caractérise par une mortalité et une nécrose sévère de la muqueuse intestinale. Cette maladie, généralement contrôlée par des additifs alimentaires antimicrobiens, a vu sa prévalence augmenter avec le retrait de plusieurs antibiotiques. Étant donné les stratégies de réduction de l’usage des antimicrobiens, de nouvelles alternatives pouvant contrôler les éclosions doivent être trouvées. Ces dernières années il a été démontré que les bactéries à coloration gram positive peuvent excréter des vésicules extracellulaires (VEs). La lumière de ces vésicules contiendrait des molécules démontrées immunogènes contre les pathogènes dont elles sont issues. À ce jour la compréhension de la composition des VEs de Clostridium perfringens et leurs interactions avec le système immunitaire aviaire est très limitée. Dans ce projet, notre hypothèse était qu’une souche de C. perfringens provenant d’un cas clinique d’entérite nécrotique peut 1) produire des vésicules extracellulaires pouvant contenir des facteurs de virulence et ainsi 2) protéger le poulet contre l’entérite nécrotique lors d’une infection expérimentale. Pour cela, la production et la caractérisation des vésicules extracellulaires ont été faites et leurs effets immunomodulateurs sur les poulets ont été étudiés dans le cadre d’infections expérimentales reproduisant l’entérite nécrotique chez des poulets de chair. À partir d’une culture d’une souche de C. perfringens netB+, des VEs ont été produits sous des conditions de croissance propres aux VEs. Les analyses protéomiques par spectrophotométrie de masses ont identifié 88 protéines présentes dans ces VEs. Sur ce total, 35,22% étaient hébergées dans le cytoplasme. Il a été constaté que la plupart de ces protéines ont des fonctions principalement liées à la traduction et à l’expression des gènes. Par contre la perfringolysine O, la collagénase et une possible entérotoxine, soit des protéines associées à la pathogénicité de C. perfringens, ont aussi été identifiées. Une première inoculation orale de ces VEs chez de poulets de chair a confirmé que les VEs administrées n’avaient pas d’effet négatif sur la croissance et le développement des poulets. Face à un challenge d’entérite nécrotique, les groupes ayant reçu des VEs ont présenté des scores lésionnels macroscopiques et histologiques dans les segments du duodénum et du jéjunum moindres (p< 0.001) que chez les contrôles positifs. De plus, il y a eu une augmentation significative des IgY dans le groupe immunisé avec des VEs et adjuvant (p <0.001). Lors d’un deuxième challenge expérimental, cette fois-ci avec immunisations in ovo puis, par voie orale, une diminution des scores lésionnels dans le duodénum (p < 0.001) et le jéjunum (p < 0.001) a aussi été observée dans les groupes immunisés avec VEs et/ou l’adjuvant comparativement au groupe contrôle positif mais sans effet significatif sur les taux d’anticorps spécifiques à C. perfringens netB+. Dans cette étude, des VEs ont été produites et caractérisées, il a ainsi été possible de déterminer qu’après l’immunisation, les VEs semble avoir conféré une protection locale plutôt qu’une réponse immunitaire sérique. Ces VEs pourraient devenir une alternative intéressante aux antibiotiques, mais davantage d’essais sont nécessaires afin de comprendre leur rôle.
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Fibronectin type III domain-containing (FNDC) : facteurs clés dans le métabolisme énergétique et les fonctions ovariennes chez la vache ?
Daudon, Mathilde; Price, Christopher A.; Dupont, Joëlle (2024-06)
La sélection génétique pour la production laitière a induit une diminution de la fertilité de la vache laitière. Au début de la lactation, les besoins énergétiques dépassent la consommation d’énergie et la vache rentre en bilan énergétique négatif (BEN). Cela induit une mobilisation du tissu adipeux, suivi, en cas de fort BEN d’une mobilisation du muscle squelettique. Les tissus adipeux et musculaire sécrètent des adipokines et des myokines, respectivement, connues pour réguler les fonctions du follicule ovarien. Plus récemment, une famille d’adipokine-myokine a été caractérisée : Fibronectin type III domain-containing (FNDC). Cependant, le rôle de cette nouvelle famille dans le BEN et la fertilité n'avait, à ce jour, pas été étudié. L’hypothèse générale de cette thèse est que les FNDCs altèrent les fonctions ovariennes. Nous avons démontré ici que l’expression génique de FNDC3A, FNDC3B, FNDC4 et FNDC5 dans le tissu adipeux était augmentée une semaine post-partum. Uniquement les concentrations plasmatiques de FNDC5/irisine étaient augmentées durant cette période et l’ajout d’irisine à des explants de tissu adipeux in vitro a augmenté la sécrétion de glycérol et l’expression génique de l’ATGL et de la LHS suggérant le rôle de l’irisine dans la lipolyse. Les FNDCs sont présents dans l’ovaire et l’injection d'irisine et de FNDC4 directement dans un follicule ovarien en croissance in vivo a provoqué une régression folliculaire. In vitro, l'irisine a modulé le métabolisme du glucose des cellules de la granulosa et de la thèque et altéré la stéroïdogenèse tandis que FNDC4 a augmenté le métabolisme du glucose des cellules de la granulosa et a modulé le métabolisme des acides gras des cellules de la granulosa et de la thèque bovines de manière insulino-dépendante. Enfin, FNDC3A a réduit la glycolyse et la sécrétion de progestérone IGF1-dépendante des cellules de granulosa. Ainsi, ces données indiquent que les FNDCs pourraient réguler la folliculogenèse en modulant la stéroïdogenèse et le métabolisme du glucose.
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The use of nutritional supplements to identify microbiota profiles associated with protection against necrotic enteritis infection in chickens
Garbin Cappellaro, Laura; Costa, Marcio; Boulianne, Martine (2024-10)
Le microbiote intestinal joue un rôle fondamental dans la santé et les performances des poulets de chair. Un déséquilibre de cette communauté microbienne, connu sous le nom de dysbiose, est associé à des maladies telles que l'entérite nécrotique (EN), qui entraîne des pertes économiques importantes dans l'élevage de volailles. Les restrictions croissantes sur l'utilisation des antibiotiques dans la production animale ont stimulé l'intérêt pour des stratégies alternatives visant à promouvoir la santé intestinale et à prévenir des maladies telles que l'entérite nécrotique. Les additifs tels que les prébiotiques, les probiotiques, les postbiotiques et les composés phytogéniques ont été reconnus pour leur capacité à améliorer les performances et la résistance aux maladies en modulant le microbiote intestinal. Cependant, la plupart des études se concentrent sur des analyses descriptives du microbiote réalisées à l'approche de la période d'abattage, ce qui limite leur utilité pour la prévention précoce des maladies. Cette étude visait à élucider la composition du microbiote intestinal et sa relation avec la NE tout en évaluant l'efficacité d'additifs alimentaires alternatifs dans la modulation du microbiote pour promouvoir la santé des poulets de chair dès la première semaine de vie. Une expérience in vivo a été menée avec 168 poulets de chair, répartis en quatre groupes : contrôle (CTRL, pas d'additifs), phytogènes (PHY, BioStrong BP®), mélange postbiotique et phytogène (SCFP+, Dia-V™PTplus), et probiotiques (PROB, Enterococcus faecalis). Des écouvillons cloacaux ont été prélevés aux jours 7, 14 et 22 pour l'analyse du microbiote à l'aide de la technologie des microarrays. Tous les oiseaux ont été soumis à un protocole d'induction de la NE, comprenant un vaccin à haute dose contre Eimeria le jour 14 et un test de Clostridium perfringens les jours 19 et 20. Le poids corporel, l'indice de consommation et les lésions intestinales ont été enregistrés. Les oiseaux ont été classés comme résistants ou sensibles sur la base des scores de lésions, et les profils de microbiote ont été analysés à l'aide de LinDA. Les résultats ont révélé que les additifs testés modulaient différemment le microbiote intestinal. Les groupes SCFP+ et PHY ont présenté des profils de microbiote distincts avec des similitudes observées dans l'analyse des clusters. Les deux groupes ont réduit de manière significative les scores de lésions intestinales par rapport au contrôle (p<0,001), et la supplémentation en SCFP+ a également amélioré le BW et le FCR (p<0,05). Des biomarqueurs microbiens spécifiques associés à la résistance et à la sensibilité à la NE ont été identifiés. Des taxons bénéfiques tels que Lactobacillus, Bifidobacterium et Enterococcus étaient liés à la résistance, pendant que des taxons opportunistes, y compris Enterobacter, identifiés au cours de la première semaine de vie, étaient associés à une dysbiose progressive et à la sensibilité. Ces résultats soulignent le potentiel de la modulation précoce du microbiote pour établir des profils microbiens protecteurs contre la NE. En conclusion, les additifs alimentaires alternatifs, en particulier le SCFP+ et le PHY, modulent efficacement le microbiote intestinal, réduisant ainsi la gravité de la NE. L'identification de biomarqueurs microbiens fournit des informations précieuses sur la résistance aux maladies médiée par le microbiote et ouvre de nouvelles possibilités d'interventions de précision dans la production de volailles. Les recherches futures devraient valider ces résultats dans des environnements d'élevage commerciaux et explorer les applications pratiques pour optimiser la santé et la productivité des poulets de chair.
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Évaluation d'une intervention intégrée répondant aux enjeux de santé à l'interface humains-chiens dans le village inuit de Kuujjuaq, Québec
Delesalle, Léa; Aenishaenslin, Cécile; Ravel, André (2024-05)
Les communautés autochtones de l’Arctique canadien sont confrontées à d’importants problèmes de santé publique liés aux chiens. Au Nunavik, un territoire du Québec situé au nord du 55e parallèle, les morsures de chiens sont 4 à 40 fois plus fréquentes que dans le reste de la province. Ces morsures peuvent transmettre la rage, une zoonose mortelle, ce qui, couplé à l’endémicité du virus chez les renards arctiques, accroît le risque d’exposition humaine (320 expositions humaines potentielles signalées entre 2008 et 2017). La situation produit également des risques pour les chiens, dont l’espérance de vie médiane est six fois plus basse que la moyenne américaine. Malgré tout, les chiens occupent encore une place sociale et culturelle centrale dans les communautés, et peuvent apporter de nombreux bénéfices pour le bien-être humain. Répondre à ces enjeux nécessite donc de reconnaître cette ambivalence, ainsi que la diversité et l’interconnexion des facteurs qui les influencent, dont la surpopulation canine, la difficulté d’accès à des services vétérinaires locaux, et les perspectives autochtones. Or, la plupart des interventions actuelles négligent cette complexité, et se révèlent peu efficaces et mal acceptées. Un changement de paradigme est donc nécessaire. Dans ce contexte, une équipe alliant des organisations locales et provinciales et des chercheuses et chercheurs du projet « Indigenous People, Dogs and Wellness » a développé une intervention intégrée : le Kuujjuaq Dog Project (KDP, « Projet chiens de Kuujjuaq »). Ce programme repose sur une approche Écosanté, qui reconnaît les liens entre la santé humaine, animale et celle des écosystèmes, et met l’accent sur une collaboration équitable avec les communautés. Mis en oeuvre en janvier 2020, le KDP comprenait des services vétérinaires locaux, des mesures éducatives (ateliers scolaires pour les enfants et publications sur Facebook) et un renforcement de la règlementation de contrôle de la population canine. Cette thèse avait pour objectif d’évaluer la mise en oeuvre et l’efficacité du KDP, un cas d’intervention intégrée basée sur la communauté, destinée à réduire les risques et améliorer les bénéfices pour la santé à l’interface humains-chiens dans une communauté nordique du Québec. Premièrement, une revue de portée a été réalisée pour identifier des méthodes d’évaluation adaptées à la complexité des interventions de santé intégrées. Elle a révélé qu’une large diversité de cadres conceptuels et de méthodes était utilisée, et a identifié des facteurs influençant le succès et la mise en oeuvre de telles initiatives, dont la qualité de la coopération intersectorielle et le niveau d’engagement des communautés ciblées. Deuxièmement, la mise en oeuvre et les effets du KDP ont été évalués après 2,5 années de fonctionnement, avec une étude transversale répétée (devis quasi expérimental prépost) et des méthodes mixtes. Les données quantitatives ont été collectées grâce à une enquête prépost réalisée auprès de 183 (pré) et 74 (post) membres de la communauté ; les données qualitatives grâce à des entretiens individuels semi-structurés avec 10 parties prenantes clés du programme et 25 autres membres de la communauté. Parmi les personnes enquêtées, 89 % connaissaient l’existence des services vétérinaires ou y avaient été exposées, contre 55 % pour les publications Facebook et 27 % pour les ateliers scolaires. L’étude a montré une amélioration non significative de plusieurs indicateurs de connaissances sur la rage et les morsures après le déploiement du KDP. Les effets perçus sur la population canine et la peur liée à la présence de chiens dans le village étaient mitigés. L’analyse de la mise en oeuvre du KDP a souligné sa pertinence et sa bonne acceptabilité socioculturelle. En cohérence avec la revue de portée, l’engagement prolongé des partenaires locaux et leur collaboration se sont révélés être des défis importants à la mise en oeuvre de l’intervention. Ces facteurs étaient exacerbés par des facteurs propres au contexte de Kuujjuaq, dont l’éloignement géographique et le manque de ressources. Nos conclusions permettent de formuler plusieurs recommandations afin d’optimiser la durabilité et l’efficacité du KDP, soit : consolider la coopération entre les organisations impliquées dans sa mise en oeuvre, encourager la mobilisation citoyenne, renforcer les activités éducatives et diversifier les stratégies de gestion de la population canine. Elle souligne aussi la nécessité d’une évaluation régulière du projet. En outre, elle contribue à combler des lacunes dans les connaissances sur l’évaluation d’interventions de santé publique complexes, et sur les facteurs influençant la mise en oeuvre de telles interventions, notamment lorsqu’elles visent les enjeux de santé liés aux chiens dans les communautés autochtones nordiques. Ainsi, sous réserve de prendre en compte les différences culturelles, structurelles et démographiques entre les villages, les résultats de cette thèse pourraient contribuer à guider la mise en oeuvre et l’évaluation de programmes intégrés et participatifs dans d’autres communautés du nord du Québec ou du Canada, confrontées à des problèmes similaires à l’interface humains-chiens.
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Effets combinés des changements climatiques et des changements d’utilisation des sols sur les populations de moustiques en Ontario
Rakotoarinia , Miarisoa Rindra; Ludwig, Antoinette; Leighton, Patrick; Ogden, Nicholas (2025-04)
The entomological context in Canada is undergoing significant transformations, marked by an increase in mosquito species over the last decade, bringing the total to approximately 80. Among these species, a minority pose a significant risk to public health due to their ability to transmit disease agents, primarily arboviruses in the Canadian context. In recent years, we have witnessed the emergence and re-emergence of human mosquito-borne diseases (MBD), caused by West Nile virus (WNV) and viruses from the California serogroup (CSV), including those of Snowshoe hare (SSHV) and Jamestown Canyon (JCV). Additionally, some diseases that affect mainly animals, like the Eastern equine encephalitis, also remain a concern for public health. These phenomena of emergence and re-emergence are often linked to climate change, which is the most studied and best-documented factor to date. However, other elements, such as land use, though less popularized, have also had scientific interest in recent years, highlighting the complexity of the issue and the importance of considering a broader range of variables in modeling mosquito populations and MBDs. Existing literature abounds with studies analyzing the separate impacts of climate or land use on mosquito populations, but the joint consideration of these two factors has rarely been addressed, particularly in the context of Canada. This gap underscores the need for investigations that explore the combination of climatic conditions and land use for a more comprehensive understanding of their influence on mosquito population dynamics. Our study aims to bridge this gap by examining specifically Eastern Ontario. First, our research used entomological data collected in the Greater Ottawa area between 2017 and 2018 to assess whether integrating land use improves understanding of observed variations in mosquito species occurrence and abundance. This involved correlating entomological data with Daymet weather data and annual crop inventory information for the same period. We analyzed two types of models: one considering only weather variables, and other including both weather and land use variables. Results highlighted the importance of considering land use, and its impact varied by species, underscoring the need to adjust models according to the species being studied. Our results have also highlighted unexplained variance, indicating that factors not considered in our study could influence the outcomes. We then extended our study area to Eastern Ontario, where we developed and modeled land use scenarios suited to the ecology of mosquitoes. The Dyna-CLUE model was used to simulate these land use scenarios until 2070, based on historical trends. We proposed five scenarios reflecting different levels of urbanization, agricultural expansion, and the conservation of natural areas. The results showed a good match between predicted and observed maps in 2020, predicting significant changes by 2050, and notable deforestation by 2070. These scenarios, developed to be combined with climate projections, were used to estimate mosquito populations. Finally, our focus shifted to Culex pipiens-restuans abundance, the main vector for WNV in the region, and to mosquito diversity, as a more general indicator of species. For this phase, the study period covered 2002 to 2020, and the study area was Eastern Ontario. The objective was to determine how Cx. pipiens-restuans abundance and mosquito diversity would evolve in the future in response to climate and land use changes. For this purpose, the previously developed and modeled land use scenarios were integrated with climate scenarios to carry out projections. Results demonstrated that land use is a relevant factor for predicting Cx. pipiens-restuans abundance. As for mosquito diversity, only the impact of climate changes proved to be decisive. Our analyses also revealed a characteristic spatial pattern of the regional landscape, showing stability in western natural areas compared to more pronounced changes in the east, more affected by human activities. Our results suggest that incorporating land use enhances our understanding of the spatio-temporal dynamics of mosquito populations. They also shed light on human activities as a factor facilitating changes in mosquito populations, thereby impacting disease transmission. This study underscores the significant role of land use and climatic conditions in the dynamics of mosquito populations, highlighting the impact of human activities on MBD transmission. Our findings emphasize that preserving natural habitats could be an effective strategy to mitigate the effects of climate change and reduce the risks associated with vector-borne diseases, adapting to changing environmental realities.
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Dynamique de colonisation des poulets de chair par deux souches de Campylobacter jejuni et interactions hôte-pathogène
Chagneau, Sophie; Thibodeau, Alexandre; Gaucher, Marie-Lou; Fravalo, Philippe (2025-03)
Campylobacter jejuni est reconnu comme la principale bactérie d’origine alimentaire responsable de gastroentérites humaines dans le monde. C. jejuni réside dans le tractus gastrointestinal de divers animaux, incluant la volaille reconnue comme étant la principale source de transmission aux humains. En raison du nombre important de campylobactérioses humaines et de l’augmentation de la consommation de poulets, il est primordial de garantir la salubrité alimentaire de la viande et des foies de poulets. L’une des stratégies repose sur la réduction de la colonisation des oiseaux par C. jejuni grâce à des mesures de contrôle à la ferme. Toutefois, un contrôle adéquat de Campylobacter chez la volaille nécessite avant tout une compréhension plus approfondie de sa colonisation. Bien que les oiseaux puissent être colonisés par différentes souches de C. jejuni compétitionnant les unes avec les autres, les mécanismes sous-jacents demeurent inconnus. Par ailleurs, la dissémination extra-intestinale de C. jejuni est très peu étudiée à ce jour. Finalement, aucune étude expérimentale évaluant les réponses immunitaires locales et systémiques induites par la colonisation de C. jejuni n’a été réalisée avec plus d’une souche. Par conséquent, cette thèse visait donc à évaluer l’impact d’une mono-infection et d’une co-infection avec deux souches de C. jejuni possédant des potentiels de compétition opposés sur leur colonisation cæcale et iléale, sur leur translocation vers le foie et sur les réponses immunitaires locales et systémiques des poulets. En outre, la colonisation intestinale de C. jejuni requière la disponibilité en acides aminés, tels que la sérine, le glutamate et la proline, pour coloniser avec succès les caeca. Ainsi, cette thèse a également évalué une mesure de contrôle reposant sur la modulation de la disponibilité en acides aminés par l’ajout d’une protéase à des moulées contenant différentes sources de protéines. Des poulets de chair de 14 jours d’âge ont été inoculés avec différentes doses de deux souches de C. jejuni possédant des potentiels de compétition opposés. Dépendamment de l’inoculum, nous avons constaté que la souche fortement compétitrice pouvait aider la souche faiblement compétitrice à coloniser l’intestin des poulets ou que les deux souches compétitionnaient l’une avec l’autre. Contrairement à la souche fortement compétitrice, nous avons observé que la souche faiblement compétitrice était capable de rejoindre et de dominer le parenchyme hépatique. La souche faiblement compétitrice semblait également profiter de la présence de la souche fortement compétitrice pour faciliter et accélérer sa propre translocation hépatique. Nous avons également observé une diminution du niveau d’expression de certaines protéines des jonctions serrées dans le tissu iléal, suggérant que C. jejuni pourrait compromettre l’intégrité de la barrière intestinale pour rejoindre le foie. De plus, C. jejuni semble moduler la réponse immunitaire intestinale afin de faciliter sa dissémination hépatique. Par ailleurs, la contamination du parenchyme hépatique par C. jejuni a déclenché une réponse immunitaire hépatique, a mené à la production des IgYs spécifiques dans le sérum des poulets et ainsi qu’à la production de l’amyloïde sérique A, une protéine de la phase aigüe, pour certaines conditions. Afin d’évaluer l’efficacité de la mesure de contrôle sur la colonisation intestinale et la translocation de C. jejuni, une protéase a été ajoutée à des moulées contenant des protéines animales ou végétales. Les poulets ont été inoculés à 14 jours d’âge par les deux mêmes souches de C. jejuni que précédemment. L’ajout de la protéase à la moulée végétale a augmenté les niveaux de colonisation iléale de C. jejuni, a diminué sa colonisation cæcale et a inhibé sa translocation hépatique. En revanche, l’ajout de la protéase à la moulée animale n’a eu aucun effet sur les niveaux de colonisation iléale et cæcale de C. jejuni. Contrairement à la moulée animale, l’ajout de la protéase à la moulée végétale a modifié la diversité et la structure du microbiote cæcal des poulets. Afin de visualiser les relations entre Campylobacter et les autres genres bactériens du microbiote cæcal, des réseaux d’associations microbiennes ont été construits. L’ajout de la protéase à la moulée végétale n’a pas eu d’impact sur la structure du réseau d’association microbienne, mais a tout de même conduit à une modification des taxons bactériens interagissant avec Campylobacter. Ces résultats permettent de mieux comprendre les interactions entre souches de C. jejuni pour la colonisation intestinale et la dissémination hépatique des poulets. De plus, la modulation de la disponibilité en acides aminés par la protéase a donné des résultats prometteurs afin de contrôler C. jejuni chez la volaille. L’ensemble de ces résultats contribueront à l’élaboration de traitements adéquats afin de contrôler la colonisation intestinale et de la dissémination extra-intestinale de Campylobacter chez la volaille.
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Factors affecting the health and performance of veal calves in Québec
Mohamed, Abdelmonem; Buczinski, Sébastien; Francoz, David; Dufour, Simon (2023-12)
Contexte : Les veaux laitiers en surplus, principalement des mâles, sont généralement vendus en jeune âge pour être engraissés dans le secteur du veau lourd. La santé et les performances de ces veaux sont d’une importance tant pour l’industrie laitière, même si la vente de veau ne représente qu’une petite partie du revenu de l’exploitation laitière, que pour l’industrie des veaux lourds. Au cours du cycle de production de veaux lourds, la mortalité et la morbidité varient en fonction du lot mais oscillent respectivement autour 5% et 20%. Parmi les facteurs de risque, une mauvaise gestion du colostrum et de l’alimentation à la ferme laitière d’origine (notamment avec du lait non commercialisable) sont souvent incriminés, ainsi que le transport et le stress lors du circuit de vente. Bien que le Québec soit le premier producteur de veaux lourds au Canada, représentant 80 % de la production nationale, les données sont rares concernant les associations entre l’immunité passive et les autres facteurs de risque d’arrivée dans les sites d’engraissement avec la morbidité, la mortalité et le gain moyen quotidien des veaux lourds au Québec. Objectifs : l’objectif de cette thèse était d’évaluer les facteurs de risque à l’arrivée dans les sites d’engraissement, en particulier le transfert d’immunité passive (TIP) associés à la morbidité, à la mortalité et au gain moyen quotidien (GMQ) des veaux lourds via (1) une revue systématique et méta-analyse ; et (2) une étude terrain. Méthodes : (1) recherche de la littérature dans les bases de données CAB abstracts (via CAB direct), PubMed et Web of Science (via ISI). Les études observationnelles et les essais randomisés publiés en anglais ou en français évaluant l’association entre un transfert inadéquat de l’immunité passive et l’un des conséquences spécifiés (c.-à-d., la mortalité, le complexe respiratoire bovin, la diarrhée, l’arthrite et l’otite) ont été inclus. La population d’intérêt était des jeunes veaux laitiers transportés dans des installations commerciales et élevés pour la production de viande de veau ou à d'autres fins de production. Les modèles de méta-analyse à effet aléatoire ont été exécutés si les données brutes ou ajustées d’au moins 5 études étaient disponibles pour une issue d’intérêt. (2) 1729 veaux de lait et de grain ont été échantillonnés au hasard au cours de la première semaine suivant leur arrivée dans 59 installations des régions de la Montérégie et du Centre du Québec. Le transfert d’immunité passive a été mesuré à l’aide du réfractomètre Brix (seuil sérique ≥ 8.4 %). La morbidité, la mortalité et le gain moyen quotidien de ces veaux ont été modélisés comme des conséquences en fonction de variables catégorielles (TIP inadéquat au niveau individuel, saison d’arrivée, sites d’achat et poids d’entrée) et une variable continue (proportion de TIP inadéquat dans le lot). Ces modèles ont été réalisés avant et après l’imputation des données manquantes. Résultats : (1) parmi 6221 résumés, 19 études ont finalement été retenues. Nous avons constaté que les veaux souffrant d’un TIP inadéquat couraient un risque de décès plus élevé que ceux avec un transfert d’immunité passive adéquat [rapport de cotes (RC) = 2.46 ; Intervalle de confiance à 95 % (IC 95%) : 1.43-4.22, n = 8 études]. Le risque de diarrhée était plus élevé chez les veaux avec un TIP inadéquat (RC = 3.03 ; IC 95 % : 1.2 à 7.62, n = 7 études). Il y avait un biais de publication important dans les 5 études rapportant le complexe respiratoire bovin comme issue. Après ajustement pour le biais de publication, l’association n’était plus statistiquement significative (RC = 1.40 ; IC 95 % : 0.77-2.6). Il n’y avait pas assez d’études pour examiner de manière adéquate les sources d’hétérogénéité pour la mortalité et la diarrhée. (2) À partir de 1729 veaux échantillonnés pour la mesure du TIP dans 59 lots, 1084 avaient un Brix% sérique inférieur à 8.4 %, ce qui indique que 62.7 % des veaux avaient un TIP inadéquat. Il n’il n’y avait pas de corrélation entre la prévalence de la morbidité ou de la mortalité dans ces 59 lots et la proportion de TIP inadéquat au niveau du lot. À l’inverse, par rapport aux veaux ayant TIP adéquat, ceux ayant TIP inadéquat étaient plus susceptibles d’être malades (RC : 1.56 ; IC 95 % : 1.2-2.05). Le TIP inadéquat n’était pas associé de manière significative à la probabilité de mortalité (RC : 1.27 ; IC 95 % : 0.74–2.18). Par rapport aux veaux arrivés à l’automne, ceux qui ont été amenés aux installations pendant l’hiver avaient un risque de mortalité plus bas (RC : 0.16 ; IC 95 % : 0.03 à 0.78). Les veaux qui ont souffert de TIP inadéquat ont acquis 0.02 kg/j de moins que ceux qui avaient TIP adéquat. De plus, les veaux arrivés aux installations pendant l’été ont acquis 0.08 kg/j de moins que ceux arrivés pendant l’automne. L’administration au moins une fois d’antibiotiques aux veaux a entraîné une réduction de 7.2 kg poids à la fin du cycle de production par rapport aux veaux non traités. Conclusion : le TIP inadéquat a été fréquemment observé chez les veaux lourds du Québec et s’est avéré associé à des risques de morbidité plus élevés et à un gain moyen quotidien plus faible. Il est recommandé de poursuivre les recherches afin d’obtenir une conclusion claire, en tenant compte de facteurs tels que l’âge auquel le transport depuis la ferme laitière a lieu, ainsi que de variables confondantes potentielles telles que la déshydratation et les comorbidités du veau.
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Évaluation de la capacité immunoprotectrice de protéines recombinantes exposées à la surface de Clostridium perfringens pour le développement d'un vaccin efficace contre l'entérite nécrotique aviaire
Heidarpanah, Sara; Gaucher, Marie-Lou; Thibodeau, Alexandre; Quessy, Sylvain; Segura, Mariela (2023-12)
Certaines souches pathogènes de Clostridium perfringens de type G provoquent l’entérite nécrotique aviaire, une maladie gastro-intestinale complexe des poulets à chair qui a de graves conséquences économiques pour l'industrie avicole mondiale, et pour laquelle, une stratégie de contrôle efficace fait actuellement défaut. En utilisant une approche par vaccinologie inverse comparative et soustractive, notre équipe a identifié 14 cibles vaccinales uniques à six souches de Clostridium perfringens causant l’entérite nécrotique et absentes des dix souches commensales. Les objectifs de la présente thèse étaient (i) d’analyser le contenu génomique d'une collection de 41 souches de Clostridium perfringens; (ii) de valider des données antérieures obtenues in silico pertinent à l'identification de 14 cibles vaccinales, de générer des protéines recombinantes et d’évaluer leur immunogénicité; (iii) d’étudier les capacités protectrices des protéines recombinantes dans un modèle d’induction expérimentale de l’entérite nécrotique; et (iv) d’étudier le lien entre les réponses immunitaires et les profils du microbiote intestinal chez des poulets de chair vaccinés soumis à ce modèle d’induction de l’entérite nécrotique. Pour atteindre le premier objectif, la présence de 20 facteurs de virulence associés à Clostridium perfringens a été documentée. Trois loci importants d'entérite nécrotique (NELoc-1, 2 et 3) ont été caractérisés et l'existence de gènes de résistance aux antibiotiques, d'éléments de prophage et de plasmides a été évaluée. De plus, l'analyse pangénomique a été réalisée. Les résultats ont révélé une grande diversité génomique dans les isolats de Clostridium perfringens, avec seulement 6% des gènes représentant le génome coeur (chapitre 4). Le deuxième article (chapitre 5) présente les résultats relatifs au deuxième objectif. Les résultats ont montré que la moitié des séquences codant pour les protéines sont présentes dans le génome de souches commensales. Donc, ces séquences ont donc été exclues des étapes subséquentes. Cinq protéines ont alors été produites et utilisées pour l'immunisation des poulets de chair. Les résultats d’analyse par ELISA ont montré que les titres d'anticorps de type IgY à 21 et 35 jours d’âge chez les oiseaux vaccinés étaient significativement plus élevés que ceux mesurés aux jours 7 et 14, et plus élevés que ceux du groupe d'oiseaux recevant l'adjuvant seul (valeur-p ≤ 0,001). Finalement, les résultats ont montré que les anticorps produits chez les oiseaux immunisés à l’aide des candidats vaccinaux offraient une protection partielle contre l’entérite nécrotique, avec seulement 30% des 80 oiseaux vaccinés présentant des lésions typiques d'entérite nécrotique. Aussi, le séquençage des amplicons de la région V4 de l’ARN ribosomal 16S a montré que l'immunisation n’a pas modifié l'abondance relative des bactéries bénéfiques productrices de butyrate, y compris Ruminococcaceae, par rapport au groupe témoin (valeur-p > 0,05). En revanche, l'abondance relative des familles bactériennes considérées comme nocives, telles que les Enterobacteriaceae, a été réduite de manière significative (valeur-p < 0,01) chez certains groupes (chapitre 6). À notre connaissance, aucune étude n'a jusqu'à présent identifié et produit de protéines candidates vaccinales exposées à la surface et uniques à Clostridium perfringens causant l’entérite nécrotique en utilisant une approche par vaccinologie inverse comparative et soustractive. Pour une application de cette approche vaccinale dans l'industrie, d'autres méthodes de livraison, y compris l'immunisation in ovo, la vaccination orale ou même l'immunisation des poules reproductrices devraient être envisagées dans les études futures.
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Étude des hôtes réservoirs de l'anaplasmose granulocytaire dans un environnement péri-domestique du sud du Québec
Audet-Legault, Raphaëlle; Bouchard, Catherine; Aenishaenslin, Cécile; Rocheleau, Jean-Philippe (2024-10)
L’anaplasmose granulocytaire humaine (AGH) est une maladie vectorielle causée par la bactérie Anaplasma phagocytophilum (Ap) et transmise par la tique Ixodes scapularis. Le variant zoonotique, dit « human active » (Ap-ha), est pathogène pour l’humain, le cheval et le chien. L’AGH est en émergence au Canada et au Québec, où un agrégat inhabituel de cas a été détecté en 2021 dans la région de l’Estrie, au sud du Québec. L’objectif de ce mémoire est de mieux comprendre quelles espèces de micromammifères sauvages peuvent être considérées comme des hôtes réservoirs compétents du variant Ap-ha, ce qui est pour le moment inconnu dans le contexte canadien. Au cours des étés 2022 et 2023, 547 micromammifères ont été capturés sur huit sites boisés péri-domestiques de la région de Bromont afin d’évaluer le niveau d’infestation par des tiques immatures, leur statut infectieux pour Ap-ha et leur capacité à infecter des larves. Nos résultats nous permettent d’affirmer que le tamia rayé (Tamias striatus) et la souris du genre Peromyscus (Peromyscus spp.) constituent des réservoirs compétents d’Ap-ha dans le sud du Québec. Il s’agit de la première étude canadienne à s’intéresser aux hôtes réservoirs de l’AGH et à détecter ce pathogène chez des espèces autres que la souris à pattes blanches au Canada. Ce projet s’inscrit dans une approche Une Seule Santé puisqu’il intègre des notions d’écologie et d’épidémiologie afin de mieux comprendre l’émergence de l’AGH et d’orienter le développement d’interventions de gestion du risque en santé humaine et animale.
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Pharmaco-toxicologie cardiovasculaire : développement et validation de biomarqueurs précliniques d'effets secondaires
Boulay, Emmanuel; Authier, Simon; Troncy, Éric (2024-11)
L'intervalle QT de l'électrocardiogramme (ECG) est un biomarqueur clé pour évaluer le risque d'arythmies induites par les médicaments, bien que son interprétation puisse conduire à des faux positifs. L'allongement du QT peut être dû à deux sous-parties distinctes : le J-Tpeak (JTp), reflétant la repolarisation précoce et associé à un risque pro-arythmique, et le Tpeak-Tend (Tpe ou TpTe), dont l'allongement seul n'est pas lié aux torsades de pointes (TdP). Les médicaments qui prolongent le QT en augmentant Tpe sans modifier JTp ne devraient pas être considérés comme pro-arythmiques. Toutefois, cette distinction n'est pas toujours prise en compte en préclinique, ce qui peut conduire à l'abandon prématuré de candidats médicamenteux. Cette thèse vise à identifier des biomarqueurs ECG plus fiables que le QT pour mieux prédire le risque pro-arythmique des médicaments en développement. Le premier volet de ce travail repose sur une étude rétrospective analysant les effets de plusieurs médicaments (dofétilide, sotalol, vérapamil, médétomidine, cisapride) sur les intervalles QTca, JTpca et Tpeca (i.e., «ca» signifiant covariate adjusted) chez le chien Beagle et le singe cynomolgus. Les résultats montrent que le dofétilide et le cisapride allongent QTca et JTpca sans affecter Tpeca chez l'animal, tandis que le sotalol prolonge tous les intervalles ECG. En revanche, le vérapamil réduit QTca et JTpca tout en augmentant Tpeca, ce qui suggère une moindre toxicité sur le QTca. Le deuxième volet explore les facteurs confondants (i.e., température corporelle, adrénaline) pouvant influencer QT et ses sous-composants chez le chien Beagle. L'adrénaline diminue QTca et JTpca, contrairement aux attentes basées sur la littérature. L'impact de divers médicaments (dofétilide, vérapamil, ranolazine) est également évalué. L'étude met en évidence la variabilité du Tpeca et explore une approche par vectocardiogramme pour améliorer sa mesure, bien que des défis méthodologiques limitent son application. Le troisième volet est une étude prospective sur le singe cynomolgus, comparant les effets du dofétilide, de la quinidine, du vérapamil et de la mexilétine aux données cliniques humaines. Les résultats montrent que dofétilide et quinidine prolongent QTca et JTpca sans modifier Tpeca, tandis que la mexilétine diminue QTca et JTpca sans effet sur Tpeca, résultats conformes aux observations cliniques. Enfin, une modélisation in silico basée sur le modèle O'Hara-Rudy permet d'évaluer l'effet de l'inhibition de différents canaux ioniques sur la durée du potentiel d'action (APD). L'inhibition d'IKr entraîne la plus forte prolongation de l'APD. L’inhibition des canaux ICa et INa prolongent également la durée du APD. L'intégration de plusieurs canaux dans la modélisation améliore la prédiction du risque pro-arythmique. Bien que l'objectif initial ait été d'identifier des biomarqueurs plus fiables que l'intervalle QT pour évaluer le risque pro-arythmique au moyen de l'ECG, nos résultats révèlent que les biomarqueurs JTpca et Tpeca peuvent être adaptés à cette tâche chez les animaux, mais l'évaluation du Tpeca reste variable et présente des limitations méthodologiques. Cette thèse met en lumière la nécessité de développer des biomarqueurs plus robustes pour améliorer l’innocuité cardiaque préclinique. Une meilleure compréhension et l'optimisation des enregistrements ECG amélioreraient l'évaluation préclinique du risque pro-arythmique et l'innocuité des médicaments.
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Dynamics of staphylococcal intramammary infections and their impact on udder health and quarter-milk yield in dairy cows
Kurban, Daryna; Dufour, Simon; Roy, Jean-Philippe; DeVries, Trevor (2025-03)
Sur les fermes laitières canadiennes, les espèces de staphylocoques sont responsables de la majorité des infections intramammaires (IIM) chez les vaches en lactation ou taries. La prévalence spécifique des espèces de staphylocoques n'est pas la même chez les vaches primipares que chez les multipares. L’objectif général de la thèse était de mieux décrire l’épidémiologie spécifiques à l’espèce des IIM aux staphylocoques et leur impact sur le compte de cellules somatiques (CCS) et la production laitière de quartiers infectés de la glande mammaire pendant les périodes de tarissement et de la lactation chez les vaches primipares et multipares. Le MALDI-TOF (spectrométrie de masse par temps de vol suite à la désorption/ionisation laser assisté par matrice) est un outil fiable pour l'identification précise, au niveau de l'espèce, de nombreux micro-organismes isolés du lait bovin. Ces microorganismes ne sont pas tous des agents pathogènes potentiels. Le premier objectif de cette thèse était de décrire les microorganismes, y compris les espèces de staphylocoques, qui ont été identifiés à partir d'échantillons de lait à l'aide du MALDI-TOF et leur association avec l’augmentation du compte de cellules somatiques (CCS), ainsi que les lacunes de connaissances concernant leur pertinence pour la santé de la mamelle. Un modèle d'étude mixte (méta-analyse et revue de recensement) a été choisi. Pour la méta-analyse, deux ensembles de données multi-pays de résultats d'échantillons de lait de quartiers (apparemment en santé, n=50 429 vs. cas de mammite clinique (MC), n=43 924) ont été organisés. Chaque espèce répertoriée dans nos ensembles de données a fait l'objet d'une recherche sur PubMed afin de déterminer si une augmentation du CCS ou des signes de MC étaient associés à l’identification de microorganismes dans le lait. Deux cent quatre-vingt-quatorze espèces différentes de micro-organismes ont été identifiées. Il n'existe aucun rapport scientifique concernant l'association avec la MC ou le CCS pour 70 % de ces espèces. Dans notre ensemble de données de MC, certaines d'entre elles ont été fréquemment isolées dans le lait des quartiers atteints de MC. Certaines des espèces de staphylocoques non-aureus (NAS) non-signalées auparavant comme agents pathogènes de la mammite (Staphylococcus agnetis, S. arlettae, S. auricularis, S. capitis, S. devriesei, S. equorum, S. gallinarum, S. haemolyticus, S. hominis, S. microti et S. succinus) ont été associées à un CCS élevé ou à des cas de MC. Pour répondre aux trois objectifs suivants de la thèse, une étude observationnelle longitudinale avec collecte de données sur cinq fermes laitières commerciales équipées d'un système de traite automatisé (QC, Canada) a été réalisée. Les fermes ont été visitées une fois aux 2 semaines pour collecter de manière aseptique des échantillons de lait de quartier de chaque vache. Environ 450 vaches ont été recrutées au tarissement (entre 28 et 14 jours avant le tarissement) ou au début de la lactation (3 à 14 jours en lait) et suivies pendant les périodes respectives (tarissement et lactation), en fonction de l'objectif. Les espèces de staphylocoques ont été identifiées dans les échantillons de lait par culture bactériologique suivie de MALDI-TOF. Le deuxième objectif était de décrire la prévalence spécifique à l'espèce des IIM aux staphylocoques lors du premier vêlage et des vêlages suivants, ainsi que leur incidence et leur persistance au cours de la période de tarissement. La prévalence des IIM aux staphylocoques varie en fonction de la parité et du stade du cycle de production (lactation ou tarissement). Les vaches primipares avaient une prévalence légèrement plus élevée d'IIM aux staphylocoques au vêlage que les vaches multipares. Staphylococcus chromogenes était l'espèce la plus fréquemment isolée au début de la première lactation. Chez les vaches plus âgées, S. aureus, S. xylosus, S. chromogenes, S. simulans, S. epidermidis et S. haemolyticus ont pu persister tout au long de la période de tarissement. Le troisième objectif de la recherche était de décrire la prévalence, l'incidence et les taux d'élimination des infections aux staphylocoques spécifiques à chaque espèce pendant la lactation. Les IIM aux staphylocoques les plus fréquentes pendant la lactation chez les vaches primipares étaient causées par S. chromogenes, tandis que les IIM de S. aureus, S. epidermidis et S. haemolyticus étaient plus fréquentes chez les vaches multipares. En général, au cours de la lactation, S. aureus, S. chromogenes, S. simulans et S. epidermidis ont surtout causé des IIM persistantes, et les IIM de S. auricularis, S. equorum, S. haemolyticus, S. hominis et S. xylosus ont surtout été transitoires. Le quatrième objectif de cette thèse était d'étudier les changements au niveau des quartiers du score de cellules somatiques du lait (SCS) et de la production de lait à la suite d'IIM causées par les espèces de staphylocoques les plus fréquentes. Chez les vaches primipares, seules les IIM post-vêlage causées par S. aureus et S. chromogenes ont été associées à une inflammation mesurable dans les quartiers infectés au cours de la lactation qui a suivi. Aucun changement mesurable de la production laitière au niveau des quartiers en relation avec les IIM aux staphylocoques post-vêlage ou en lactation n'a été observé chez les vaches primipares. Chez les vaches multipares, seules les IIM causées par S. aureus et S. epidermidis en début de lactation ont été associées à un SCS plus élevé au niveau du quartier et à une perte de production laitière au niveau du quartier au cours de la lactation qui a suivi. Malgré l'inflammation mesurable associée à de nombreuses IIM aux NAS, il n'y avait généralement pas de corrélation négative avec la production laitière. Par conséquent, la lutte contre ces infections dans les exploitations laitières n'est probablement pas une priorité, mais elle peut avoir un impact positif sur la qualité du lait de réservoir (c'est-à-dire, le contrôle du niveau de CCS).
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Functions of tribbles (TRIB) pseudokinase proteins in the bovine ovary
Pashaei, Maryam; Ndiaye, Kalidou (2024-07)
La croissance folliculaire anormale, l'anoestrus et l'anovulation sont parmi les principales causes de la baisse de fertilité chez les bovins laitiers à haut rendement. Lors de la croissance folliculaire et de l'ovulation, les cellules stéroïdogènes, y compris les cellules de granulosa (GC), jouent un rôle crucial dans la maturation et la libération de l'ovocyte. Il est donc essentiel de décrire en détail les processus physiologiques et pathologiques régulant la fonction ovarienne. Des études précédentes de notre laboratoire ont identifié et caractérisé pour la première fois un membre de la famille des pseudo-kinases Tribbles (à savoir TRIB2) dans les cellules ovariennes de granulosa. La famille Tribbles comprend des protéines de type sérine-thréonine kinase largement exprimées (TRIB1, TRIB2 et TRIB3) qui peuvent jouer des rôles cruciaux dans divers processus biologiques tels que la coordination de la mitose et de la morphogenèse, la maturation des ovocytes et la prolifération cellulaire. Cependant, leurs rôles exacts dans la fonction des cellules de granulosa et leurs effets sur les voies de signalisation impliquées dans la croissance folliculaire et l'ovulation restent inconnus. Nous avons émis l'hypothèse que les pseudo-kinases TRIB jouent des rôles cruciaux dans la régulation de la fonction et de l'activité des cellules de granulosa au cours des dernières étapes du développement folliculaire et peuvent activer des voies de signalisation distinctes. L'objectif de la présente étude était donc d'examiner les fonctions des membres TRIB dans les cellules de granulosa bovine avec les objectifs spécifiques suivants : 1) Analyser l'expression et la régulation des membres TRIB dans différents types cellulaires folliculaires et modèles de culture ; 2) Étudier les fonctions des membres TRIB dans les cellules GC en utilisant l'approche CRISPR/Cas9. En utilisant un modèle d'étude in vivo composé de cellules GC obtenues à partir de follicules à différents stades de développement, nous avons confirmé la régulation négative de TRIB2 par l'hormone lutéinisante (LH) / hormone chorionique gonadotrope humaine (hCG) et la régulation positive de TRIB1 et TRIB3 aux niveaux de l'ARN et des protéines par la LH. Nous avons montré que TRIB2 est presque exclusivement présent dans les cellules GC et dans les follicules dominants (DF) alors qu'il est absent dans les cellules de la thèque (TC) et régulé négativement dans les follicules ovulatoires (OF) par hCG, tandis que TRIB1 et TRIB3 sont présents dans les cellules TC des DF ou OF. TRIB1 et TRIB3 sont exprimés dans les cellules GC uniquement dans les OF post-hCG et non dans les DF. Les résultats suggèrent que la contribution des cellules TC à l'expression de TRIB2 dans l'ovaire bovin est très limitée par rapport aux cellules GC. Nos données ont montreé que TRIB1 et TRIB3 sont induits par hCG, suggérant des rôles significatifs, respectivement, dans le processus d'ovulation ou la formation et la fonction du corps jaune. Les résultats d'immunohistochimie ont montré la présence de TRIB2 dans la couche GC des DF par rapport à la couche TC et absente dans les OF post-hCG. L'analyse par Western blot a montré que TRIB2 et TRIB3 sont induits par la FSH mais à des moments différents. De plus, les données in vitro ont confirmé que la LH supprime l'expression de TRIB2, tandis que l'expression de TRIB3 est induite par la LH, en particulier 6 heures après le traitement avec LH. L'inhibition de TRIB3 via CRISPR/Cas9 suggère que, bien que TRIB3 puisse avoir un effet positif sur la voie de signalisation AKT dans les cellules GC, il a des effets négatifs sur la voie de signalisation P38MAPK. Nos données actuelles fournissent des preuves que TRIB2 pourrait être impliqué dans la prolifération des cellules GC et le développement folliculaire, tandis que TRIB1 et TRIB3 pourraient être impliqués respectivement dans les processus d'ovulation et de lutéinisation. En conclusion, les TRIB jouent des rôles cruciaux dans la régulation de la fonction et de l'activité des cellules de granulosa au cours du développement folliculaire et peuvent activer des voies de signalisation distinctes.
Embargo
In vivo analysis of the effects of emerging enniatin mycotoxins using a murine Model of human intestinal microbiota
Maytayapirom, Nantaporn; Alassane-Kpembi, Imourana; Costa, Marcio (2024-08)
Cette étude visait à évaluer l’impact d’une exposition à des doses faible et élevée d’un mélange de mycotoxines émergentes du groupe des enniatines sur le microbiote intestinal à l’aide d’un modèle murin humanisé Sprague Dawley. L'hypothèse était que l'utilisation de ce modèle humanisé permettrait de caractériser la dysbiose induite par les enniatines. L'étude comprenait trois parties. Dans la phase initiale, une déplétion du microbiote a été induite chez 24 rats Sprague Dawley par un traitement par un cocktail d'antibiotiques mélangé à du sirop de cassis pendant 14 jours. Par la suite, les rats ont été répartis de façon aléatoire en deux groupes, recevant chacun des matières fécales fraîches par transferts fécaux bi-hebdomadaires de deux donneurs humains adultes (un mâle et une femelle) en bonne santé, pendant 3 semaines. Dans la phase finale, les 24 rongeurs humanisés ont été divisés en trois groupes en fonction de leur dose d’exposition orale aux enniatines pendant quatre semaines: un groupe contrôle (0 μg/kg de poids corporel d’enniatine), un groupe recevant 2 μg/kg de poids corporel d’enniatines par jour, correspondant au niveau d’exposition moyen aux enniatines dans la population humaine, et un groupe recevant 200 μg/kg de poids corporel d’enniatines par jour. Les doses d’enniatines étaient administrées mélangées à du syrop de cassis. Des échantillons fécaux ont été collectés au début, et chaque semaine tout au long de cette phase. La structure et la diversité du microbiote ont été évaluées à l’aide du kit d’extraction d’ADN de matières fécales QIAamp DNA stool micro kit et de la méthode du séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S. Les résultats de la phase de déplétion ont montré des différences significatives avant et après le traitement antibiotique, confirmant l'épuisement de la flore intestinale initiale des rats par le cocktail d'antibiotiques. De plus, nous avons réussi à générer un modèle de rat humanisé à partir du microbiote intestinal humain. L'établissement réussi d'un modèle animal humanisé a été confirmé par le transfert de divers phylums bactériens, notamment Bacteroidaceae, Bacteroidales, Bacteroides, Barnesiella, Bifidobacterium, Desulfovibriionales, Eggerthella, Enterococcaceae, Hungatella, Lachnospiraceae, Lactobacillaceae, Limosilactobacillus, Mycobacteriales, Peptostreptococcaceae, Romboutsia et Streptococcus. Dans la phase finale de l'étude, l'abondance relative de certains genres bactériens a été modifiée de manière dose-dépendante par l’exposition aux enniatines, bien que l'impact global des mycotoxines ait été limité. Cet impact global limité peut être dû au fort effet homogénéisant du sirop de cassis sur le microbiote dans tous les groupes expérimentaux, masquant potentiellement les effets des enniatines sur la structure du microbiote. Ces résultats indiquent que l’exposition aux enniatines, même aux doses moyennes observées dans la population humaine pourraient modifier significativement la composition du microbiote intestinal humain.
Accès libre
Caractérisation des effets d'un traitement probiotique sur la colonisation de Salmonella Typhimurium en présence d’un microbiote dérivé du contenu intestinal de porcelets maintenu dans un bioréacteur amélioré
Grandmont, Amély; Thibodeau, Alexandre; Rhouma, Mohamed; Létourneau-Montminy, Marie-Pierre (2023-12)
Salmonella est une bactérie zoonotique habituellement associée à un état de portage asymptomatique chez le porc. L’humain peut s’infecter principalement avec la consommation de produits dérivés du porc contaminés ce qui peut causer des gastro-entérites. Parfois, des complications peuvent avoir de graves conséquences. Quelques méthodes sont présentement utilisées pour contrôler Salmonella à la ferme, mais leur efficacité est variable. Les probiotiques ont été documentés comme une alternative intéressante aux antimicrobiens, notamment les Bacillus spp. Certaines études rapportent l‘efficacité des Bacillus contre Salmonella en plus d’avoir la capacité d’améliorer la santé digestive des porcs en partie grâce à leur grande production d’enzymes. Ce projet vise à caractériser l’effet inhibiteur d’un produit liquide à base de Bacillus contre Salmonella Typhimurium dans un système in vitro reproduisant en partie le microbiote intestinal du porc. Dans un premier temps, l’effet antibactérien du produit a été testé contre plusieurs bactéries, dont S. Typhimurium, de manière individuelle avec deux méthodes différentes : la méthode de diffusion sur disque et la méthode en bouillon. Le produit probiotique a été séparé en deux phases afin de mesurer l’effet du surnageant et du culot par ces méthodes. Les résultats provenant de la diffusion sur disque ont montré une inhibition de toutes les bactéries testées, mis à part le culot contenant les bactéries probiotiques Bacillus qui n’a pas montré d’effets contre S. Typhimurium. Les essais en bouillon ont montré une inhibition de Salmonella en 10 minutes et 6 heures pour des concentrations de Salmonella de 103 et 106 UFC respectivement. Dans un deuxième temps, des essais en bioréacteur ont été réalisés afin de mesurer l’effet inhibiteur du produit à base de Bacillus sur une communauté microbienne complexe, maintenue dans un bioréacteur, provenant du côlon de porcelets et qui a été inoculée avec S. Typhimurium. Deux modes d’administration du probiotique ont été testés : une dose quotidienne et une dose en continu. Des échantillons ont été récoltés pour mesurer les changements de la composition du microbiote associés à la présence du probiotique à T0, T24, T48, T72, T96 et T120 heures. Les résultats de cette phase du projet ont montré une diminution de Salmonella, une augmentation des bactéries totales et une modulation du microbiote (diversité alpha et bêta) pour les deux modes d’administration (p < 0,05). Le traitement en continu a été associé à plusieurs modifications significatives dans la composition du microbiote (p < 0,05). L’énergie, les protéines brutes et les acides gras à chaine courte (AGCCs) ont été quantifiés pour mesurer l’activité de ce microbiote. Une diminution de la concentration totale (mM/ml) des AGCCs, de l’acétate et une augmentation en proportion du propionate ont été observées (p < 0,05). Cette étude a permis de démontrer l’effet inhibiteur du produit à base de Bacillus sur Salmonella dans un contexte de communauté microbienne complexe en plus de montrer son potentiel en tant que modulateur du microbiote intestinal porcin.
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Facteurs nutritionnels en prévêlage optimisant la qualité du colostrum et sa composition en vitamine B12 dans les fermes laitières au Québec
Dubois, Kathrin; Buczinski, Sébastien; Duplessis, Mélissa; Côrtes, Cristiano (2024-09)
Le colostrum de la vache est indispensable pour la santé et le bon développement de son veau, mais plus spécialement sa teneur en immunoglobulines et sa composition nutritionnelle. Puisque la circulation sanguine de la vache et du veau sont séparés durant la gestation, la consommation d’un colostrum de qualité rapidement après la naissance assure une réduction des taux de morbidité et de mortalité pour le veau immunonaïf et dont le rumen est sous-développé. Une hypothèse concernant la composition de la diète en prévêlage a été émise, supposant que celle-ci causerait une certaine variation de la composition du colostrum en immunoglobuline G (IgG) ainsi qu’en d’autres nutriments tels que la vitamine B12. L’objectif de cette étude était de déterminer les facteurs nutritionnels en prévêlage qui influencent les concentrations colostrales en vitamine B12 et en IgG. Au total, 62 troupeaux laitiers commerciaux du Québec ont été recrutés et les données de 51 de ces derniers ont été analysées dans le cadre de cette étude observationnelle. Dans chaque troupeau, de 3 à 12 vaches de 0 à 33 jours avant le vêlage ont été recrutées, pour un total de 494 vaches. Avant le vêlage, les vaches ont subi une prise de sang, leur poids corporel a été estimé et tous les ingrédients de la ration donnée aux vaches ont été échantillonnés et leurs quantités offertes respectives prises en note. Sur les 62 troupeaux initiaux, 22 possédaient un supplément en vitamine B12 dans la ration en prévêlage, alors que 40 troupeaux, non. Les producteurs ont prélevé un échantillon de colostrum issu de la première traite après le vêlage et ont rempli un questionnaire concernant la gestion du colostrum de chaque vache. Les échantillons de colostrum ont été analysés pour déterminer leur concentration en IgG et en vitamine B12. Les rations ont été reconstituées avant l’analyse de la composition nutritionnelle par chimie humide. Nos résultats suggèrent que la vitamine B12 dans le colostrum est positivement associée aux fibres alimentaires, ainsi qu’aux concentrations de phosphore, de cuivre et de zinc, et négativement associée à l’amidon, au gras et aux glucides non-fibreux de la ration. Une relation positive a également été observée entre la concentration colostrales en vitamine B12 et la supplémentation en vitamine B12 ainsi qu’avec les acides gras non estérifiés dans le plasma avant le vêlage. Une période de tarissement de plus de 65 jours a été associée à une plus faible concentration colostrale en vitamine B12 et les vaches entamant leur deuxième et troisième lactation comptaient des concentrations colostrales en vitamine B12 supérieures à celles des vaches de quatrième lactation en plus. La concentration sanguine en β-hydroxybutyrate de la vache avait un impact négatif sur la concentration colostrale en IgG. Il y a également été observée un impact négatif des pourcentages de suppléments protéiques et de minéraux sur la concentration colostrale en IgG, et une association positive entre cette concentration avec le pourcentage de supplément énergétique commerciaux. Nos modèles multivariés mixtes permettent d’expliquer 33 et 16% (pseudo-R2), respectivement, de la variation des concentrations colostrales en vitamine B12 et en IgG. Cela suggère donc que d’autres facteurs n’étant pas inclus dans l’étude actuelle ont un impact sur la variation de la concentration colostrale en vitamine B12 et en IgG.
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Portrait de la colonisation par le Staphylococcus aureus sensible ou résistant à la méticilline chez les chevaux admis dans un centre hospitalier universitaire : prévalence et facteurs de risque de colonisation
Allano, Marion; Sauvé, Frédéric; Archambault, Marie; Arsenault, Julie (2024-04)
La bactérie Staphylococcus aureus (S. aureus) est un microorganisme aux multiples facettes. Les isolats résistants à la méticilline (SARM) constituent une cause majeure d'infections nosocomiales, tant en médecine humaine que vétérinaire. Les données épidémiologiques sont importantes pour l’élaboration de programmes de prévention et de contrôle des infections en milieu hospitalier. L’objectif principal de cette étude est d’estimer la prévalence et étudier les facteurs de risque de colonisation par le S. aureus et le SARM des chevaux présentés à l’hôpital équin de la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Montréal. Les objectifs secondaires sont de déterminer la présence de SARM sur la peau chez les individus colonisés, et évaluer la durée de la colonisation par le SARM. Une étude transversale, menée sur 3 ans, a permis le recrutement de 228 chevaux admis pour des motifs non urgents au Centre Hospitalier Universitaire Vétérinaire (CHUV) de la faculté de médecine vétérinaire de Saint-Hyacinthe. Des prélèvements nasaux et de peau ont été réalisés à l'admission. Les échantillons nasaux ont été soumis au laboratoire de microbiologie pour culture et identification des S. aureus, grâce à la technologie MALDI-TOF. Les isolats résistants à la méticilline ont été identifiés à l’aide de géloses sélectives chromogéniques, et confirmés par un test de concentration minimale inhibitrice à l'oxacilline et une technique de diagnostic moléculaire (PCR mecA et mecC). En cas de SARM détecté sur le prélèvement nasal, l’échantillon de peau était soumis. Les prélèvements nasaux ont été répétés chez les individus colonisés jusqu'à l'obtention de deux cultures négatives. Pour l’exploration des facteurs de risque, les informations concernant la gestion de l'écurie, le type d’activité et les antécédents médicaux des chevaux ont été obtenues auprès des propriétaires via un questionnaire et la consultation des dossiers médicaux. Des régressions logistiques multivariées ont été utilisées pour modéliser les associations entre les facteurs de risque et la colonisation. La prévalence du portage nasal de S. aureus et de SARM dans la population de l’étude est respectivement de 17,5 % (IC à 95 % : 12,4-22,7) et de 6,2 % (IC à 95 % : 2,9-9,4). Les facteurs de risque de colonisation par le S. aureus et le SARM sont une hospitalisation dans les 6 mois précédents (S. aureus : rapport de cotes (RC) 3,5 – intervalle de confiance (IC) à 95 % 1,4-8,7 ; SARM : RC 6,1 - IC à 95 % 1,0-35,7) et l'année d'admission au CHUV (2022 vs. 2020-2021 ; 4 S. aureus: RC 3,3 – IC à 95% 1,5-7,1 ; RC 8,8 - IC à 95 % 1,7-90,9). De plus, être hébergé dans une écurie de plus de 10 chevaux constituait un facteur de risque additionnel d’être colonisé par le SARM (RC 5,9 - IC à 95 % 1,1-63,3). Aucun SARM n’a été détecté sur les prélèvements de peau des chevaux colonisés d’après les échantillons nasaux. Sur les 10 chevaux colonisés par le SARM et pour lesquels un suivi était disponible, un seul a été testé positif jusque 3 mois après l’admission. Un autre testait positif jusqu’à 30 jours suivant l’échantillonnage initial et 8 chevaux étaient négatifs au premier prélèvement de suivi, environ 14 jours après l’admission. La prévalence de colonisation nasale par le SARM dans notre population d’étude est non négligeable ; cependant, le portage semble transitoire. Outre des facteurs de risque d’ordre médical, l'importance des interactions sociales dans la transmission du SARM chez les chevaux est à prendre en considération.

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